הערכה משמשת לאיתור איכותני במבחנה של הגנים ORF1ab/N/S של נגיף הקורונה החדש 2019-nCoV בדגימות נשימתיות כולל ספוגיות של הפה, ספוגית אף, כיח וביצוע הקלדת מוטציה ב-HV69-70 del בו-זמנית.כפי שדווח במסד הנתונים של GISAID, יותר מ-95% מרצפי וריאנטים של Omicron שדווחו כוללים מחיקה ב-HV69-70, שעלולה לגרום לכשל ב-S genet target (SGTF) במבחני PCR.SGTF יכול לשמש כסמן פרוקסי למסך עבור Omicron.
ערכות פריימר ובדיקה מתויגת FAM מיועדות לזיהוי ספציפי של גן מעבדה ORF של 2019-nCoV, בדיקה מסומנת VIC עבור גן N של 2019-nCoV, בדיקה מסומנת ROX עבור גן S HV69-70 או מוטציה של 2019-nCoV.גן RNase P אנושי המופק במקביל לדגימת הבדיקה מספק בקרה פנימית לאימות הליך מיצוי הגרעין ושלמות הריאגנטים.בדיקה המכוונת לגן RNase P אנושי מסומנת ב-CY5.
מערכת PCR בזמן אמת: Aehealth Diagenex AL, ABI 7500, ViiATM 7, Quant Studio 7 flex.Roche Lightcycler 480, Agilent Mx3000P/3005P, Rotor-GeneTM6000/0.Bio-Rad CEX96 TouchTM SLAN-96S.SLAN-96P, MA 6000;